Index: link id, click on each number to highlight the corresponding link in the 3D visualization.
Node1 Node2: the two nodes of the corresponding link.
Owner: the name of the network the link belong to or "Shared" if the corresponding link is present in both networks.
Strength: the interaction strength between the two nodes or 0 if the link is not present.
Hub1?, Hub2?: "Yes" if the corresponding node has more than 3 links, otherwise "No".
ConSurf1, ConSurf2: these columns report the ConSurf conservation grades of the two nodes involved in a link.
Index | Node1 | Node2 | Owner | nucleotide_off Int. Strength | nucleotide_on Int. Strength | nucleotide_off Hub1? | nucleotide_on Hub1? | nucleotide_off Hub2? | nucleotide_on Hub2? | ConSurf1 | ConSurf2 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1x36 | 2x65 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
2 | 1x39 | 2x60 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | No | No | 6 | 7 |
3 | 1x39 | 7x39 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | No | Yes | 6 | 5 |
4 | 1x40 | 2x61 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 4 | 6 |
5 | 1x49 | 7x50 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 8 | 9 |
6 | 1x53 | 7x53 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 9 | 9 |
7 | 1x55 | 8x57 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 7 |
8 | 2x38 | 3x49 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 6 | 9 |
9 | 2x39 | 2x43 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 8 | 8 |
10 | 2x39 | 3x50 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 8 | 9 |
11 | 2x42 | 3x46 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | No | No | 8 | 9 |
12 | 2x43 | 7x53 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
13 | 2x45 | 4x50 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 9 | 9 |
14 | 2x53 | 3x35 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 8 | 7 |
15 | 3x22 | 3x26 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 3 | 5 |
16 | 3x23 | E2 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 1 | 3 |
17 | 3x29 | E2x52 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | Yes | 4 | 4 |
18 | 3x32 | 3x33 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 6 | 4 |
19 | 3x33 | Lig | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 4 | 0 |
20 | 3x36 | 6x48 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 6 | 8 |
21 | 3x37 | 5x43 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | No | No | 6 | 5 |
22 | 3x44 | 5x54 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 7 | 8 |
23 | 3x47 | 5x54 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 9 | 8 |
24 | 3x49 | 3x50 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | Yes | No | 9 | 9 |
25 | 3x49 | I2x57 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 9 | 7 |
26 | 3x50 | 3x53 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 9 | 8 |
27 | 3x50 | 6x33 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 9 | 7 |
28 | 3x51 | 5x61 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 7 | 9 |
29 | 5x47 | 5x51 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 5 | 6 |
30 | 5x51 | 6x45 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 6 | 6 |
31 | 5x58 | 6x38 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | No | No | 9 | 6 |
32 | 5x65 | 6x31 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 8 | 5 |
33 | 5x68 | 6x27 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 7 | 1 |
34 | 6x40 | 7x52 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 8 | 8 |
35 | 6x44 | 7x45 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | Yes | No | 9 | 9 |
36 | 6x51 | 7x38 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 6 | 5 |
37 | 6x58 | Lig | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | Yes | Yes | 4 | 0 |
38 | 6x59 | 6x60 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 4 |
39 | 7x34 | 7x38 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 4 | 5 |
40 | 7x49 | 7x53 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | Yes | Yes | 9 | 9 |
41 | 7x53 | 8x50 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | Yes | Yes | 9 | 9 |
42 | 1x31 | 7x35 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | Yes | 4 | 3 |
43 | 1x57 | 7x53 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
44 | I2x51 | I2x52 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 6 | 5 |
45 | E1x50 | E2x50 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 3 | 9 |
46 | E3 | NT | nucleotide_off | 100 | 0 | No | Yes | Yes | No | 3 | 0 |
47 | 7x24 | NT | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 0 | 0 |
48 | Lig | NT | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | Yes | No | 0 | 0 |
49 | 7x28 | NT | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 0 | 0 |
50 | 7x31 | NT | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 3 | 0 |
51 | 1x32 | E1 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | Yes | No | No | 4 | 0 |
52 | I1 | I1 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
53 | 2x44 | I1 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 5 | 0 |
54 | 2x60 | 2x64 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 7 | 3 |
55 | 3x36 | 3x37 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 6 | 6 |
56 | 3x37 | 6x52 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | No | No | 6 | 7 |
57 | 3x42 | 4x49 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 8 | 7 |
58 | 3x42 | 4x50 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | No | 8 | 9 |
59 | 4x63 | 5x36 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 5 | 5 |
60 | 5x47 | 5x48 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 5 | 5 |
61 | 5x58 | 6x42 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | No | No | 9 | 5 |
62 | 6x58 | 7x34 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 4 |
63 | 6x62 | Lig | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 0 | 0 |
64 | 7x23 | E3 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | Yes | 0 | 3 |
65 | 8x51 | 8x53 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | Yes | 8 | 6 |
66 | 4x59 | 5x35 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 6 | 0 |
67 | 5x44 | 6x55 | nucleotide_off | 100 | 0 | Yes | Yes | Yes | No | 5 | 5 |
68 | 6x46 | 6x49 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | No | No | 6 | 7 |
69 | 5x33 | 6x62 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
70 | 3x55 | 3x56 | nucleotide_off | 65 | 0 | No | No | No | No | 7 | 6 |
71 | 1x43 | 2x58 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 8 |
72 | 5x51 | 5x55 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 6 | 5 |
73 | 1x58 | 1x59 | nucleotide_off | 55 | 0 | No | No | No | No | 3 | 5 |
74 | 3x50 | 6x30 | nucleotide_off | 75 | 0 | Yes | No | Yes | Yes | 9 | 6 |
75 | 2x54 | 2x57 | nucleotide_off | 75 | 0 | No | No | Yes | Yes | 7 | 6 |
76 | 6x58 | 7x30 | nucleotide_off | 50 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 4 |
77 | 6x54 | 7x37 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 5 |
78 | 1x56 | 8x53 | nucleotide_off | 62.5 | 0 | No | No | No | Yes | 8 | 6 |
79 | E1x49 | E2 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 0 | 3 |
80 | 8x49 | 8x52 | nucleotide_off | 52.5 | 0 | No | No | No | No | 6 | 4 |
81 | 2x63 | 2x64 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | No | 3 | 3 |
82 | 1x43 | 1x44 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 5 |
83 | 2x47 | 7x53 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 9 | 9 |
84 | 1x30 | 1x35 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 5 | 5 |
85 | 5x63 | 5x67 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 4 |
86 | 6x34 | 6x37 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 7 | 8 |
87 | 3x54 | 6x30 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 9 | 6 |
88 | 1x60 | I1x49 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 6 | 6 |
89 | 5x65 | 6x32 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 8 | 7 |
90 | 1x60 | 8x49 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 6 | 6 |
91 | 7x30 | 7x32 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 1 |
92 | 3x52 | I2x57 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 7 |
93 | 6x40 | 7x49 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
94 | 1x42 | 7x47 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 7 | 6 |
95 | 3x27 | 3x31 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 4 | 4 |
96 | 4x54 | 4x58 | nucleotide_off | 52.5 | 0 | No | No | No | No | 3 | 4 |
97 | 5x38 | E2 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 3 | 3 |
98 | 1x47 | 1x51 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 6 | 5 |
99 | 8x50 | 8x54 | nucleotide_off | 50 | 0 | Yes | Yes | Yes | No | 9 | 7 |
100 | 2x56 | 3x28 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 6 | 6 |
101 | 6x60 | 6x64 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 0 |
102 | 6x54 | 7x33 | nucleotide_off | 30 | 0 | No | No | No | No | 4 | 4 |
103 | 7x54 | 8x54 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | Yes | No | 7 | 7 |
104 | 8x58 | 8x63 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
105 | 3x34 | 4x53 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 5 | 8 |
106 | 2x49 | 4x50 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | Yes | No | 8 | 9 |
107 | 1x29 | NT | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | No | 6 | 0 |
108 | 1x54 | 2x51 | nucleotide_off | 12.5 | 0 | No | No | No | No | 7 | 7 |
109 | 7x27 | NT | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | No | 0 | 0 |
110 | 6x26 | 6x30 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 3 | 6 |
111 | 5x69 | 6x27 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 1 |
112 | 8x55 | 8x59 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
113 | 5x41 | 6x56 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 5 |
114 | 3x39 | 6x44 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 9 | 9 |
115 | 5x60 | 5x63 | nucleotide_off | 37.5 | 0 | No | No | No | No | 4 | 4 |
116 | 7x54 | 7x55 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 7 | 6 |
117 | 6x32 | 7x56 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 7 | 7 |
118 | 3x30 | 4x60 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 6 | 4 |
119 | 3x24 | E1x52 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 7 |
120 | 6x49 | 6x53 | nucleotide_off | 32.5 | 0 | No | No | No | No | 7 | 6 |
121 | 1x58 | 2x44 | nucleotide_off | 37.5 | 0 | No | No | Yes | No | 3 | 5 |
122 | 6x36 | 7x55 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 8 | 6 |
123 | 1x30 | 7x36 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 3 |
124 | 3x52 | I2x56 | nucleotide_off | 32.5 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
125 | 7x43 | 7x48 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 5 | 6 |
126 | 5x62 | 5x66 | nucleotide_off | 30 | 0 | No | No | No | No | 6 | 5 |
127 | 4x62 | 4x63 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 5 |
128 | 5x34 | 6x63 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
129 | 2x62 | 2x66 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 3 |
130 | 5x68 | 6x32 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 7 | 7 |
131 | 7x23 | 7x26 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
132 | 5x58 | 6x39 | nucleotide_off | 25 | 0 | Yes | Yes | No | No | 9 | 6 |
133 | 2x38 | 4x38 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 6 | 8 |
134 | 3x41 | 4x52 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 4 | 4 |
135 | 6x35 | 6x39 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 7 | 6 |
136 | 1x55 | 8x61 | nucleotide_off | 50 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 6 |
137 | 2x41 | 4x43 | nucleotide_off | 20 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 1 |
138 | 3x48 | 3x52 | nucleotide_off | 37.5 | 0 | No | No | No | No | 6 | 5 |
139 | 3x55 | 5x64 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | No | No | No | No | 7 | 5 |
140 | 2x44 | 2x48 | nucleotide_off | 25 | 0 | Yes | No | No | No | 5 | 6 |
141 | 5x62 | 6x35 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 6 | 7 |
142 | 2x51 | 2x55 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 7 | 4 |
143 | 1x32 | 2x66 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | Yes | No | No | 4 | 3 |
144 | 6x29 | 8x50 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | Yes | Yes | 6 | 9 |
145 | 1x28 | 1x29 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 0 | 6 |
146 | 2x41 | 4x39 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 3 |
147 | 5x30 | E2 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | Yes | Yes | 0 | 3 |
148 | 2x551 | 2x59 | nucleotide_off | 50 | 0 | No | No | No | No | 5 | 5 |
149 | 1x33 | 1x34 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
150 | 5x69 | 6x24 | nucleotide_off | 15 | 0 | No | No | No | No | 4 | 2 |
151 | 6x461 | 6x47 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 0 | 8 |
152 | 4x47 | 4x51 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 4 | 4 |
153 | 3x29 | 4x64 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 4 | 0 |
154 | 6x56 | 6x57 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
155 | 7x23 | 7x25 | nucleotide_off | 25 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
156 | 5x33 | 6x63 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
157 | 5x31 | 5x35 | nucleotide_off | 12.5 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
158 | 1x41 | 1x45 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
159 | 5x71 | 5x72 | nucleotide_off | 12.5 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
160 | 6x21 | 6x24 | nucleotide_off | 7.5 | 0 | No | No | No | No | 0 | 2 |
161 | 5x31 | 5x32 | nucleotide_off | 12.5 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
162 | 3x20 | 3x22 | nucleotide_off | 12.5 | 0 | No | No | No | No | 0 | 3 |
163 | 5x52 | 5x56 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 3 | 4 |
164 | 6x25 | 6x29 | nucleotide_off | 12.5 | 0 | No | No | No | No | 3 | 6 |
165 | 5x72 | I3 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | No | No | No | No | 0 | 4 |
166 | I2x54 | I2x55 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | No | No | No | No | 4 | 5 |
167 | 4x41 | 4x44 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 3 |
168 | 6x30 | I3 | nucleotide_off | 0 | 0 | Yes | Yes | No | No | 6 | 4 |
169 | 8x54 | 8x58 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | Yes | No | No | No | 7 | 5 |
170 | 1x55 | 8x62 | nucleotide_off | 0 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 3 |
171 | 2x41 | I1x51 | nucleotide_off | 7.5 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 7 |
172 | 6x22 | 6x26 | nucleotide_off | 5 | 0 | No | No | No | No | 3 | 3 |
173 | 2x65 | 2x67 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 4 | 0 |
174 | 4x51 | 4x55 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 4 | 4 |
175 | 6x58 | 7x29 | nucleotide_off | 0 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 0 |
176 | 8x61 | 8x64 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | No | No | No | No | 6 | 5 |
177 | 6x23 | 6x26 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | No | No | No | No | 4 | 3 |
178 | 1x27 | 1x30 | nucleotide_off | 2.5 | 0 | No | No | No | No | 0 | 5 |
179 | 8x64 | 8x65 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 0 |
180 | 5x70 | 5x73 | nucleotide_off | 0 | 0 | No | No | No | No | 0 | 0 |
181 | 1x35 | 1x39 | Shared | 100 | 100 | Yes | Yes | Yes | Yes | 5 | 6 |
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183 | 1x35 | 7x35 | Shared | 100 | 100 | Yes | Yes | No | Yes | 5 | 3 |
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364 | 4x59 | 4x60 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 6 | 4 |
365 | 4x59 | E2 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 6 | 3 |
366 | 4x60 | E2 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 4 | 3 |
367 | 5x42 | E2 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | Yes | Yes | Yes | 5 | 3 |
368 | 5x36 | 5x38 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 5 | 3 |
369 | 5x39 | 5x40 | nucleotide_on | 0 | 100 | Yes | Yes | No | Yes | 6 | 5 |
370 | 5x40 | 5x43 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | Yes | No | No | 5 | 5 |
371 | 5x411 | 6x60 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 4 | 4 |
372 | 5x44 | 5x47 | nucleotide_on | 0 | 100 | Yes | Yes | No | No | 5 | 5 |
373 | 5x51 | 6x44 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 6 | 9 |
374 | 5x51 | 6x49 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 6 | 7 |
375 | 5x54 | 5x58 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
376 | 5x54 | 6x44 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
377 | 5x55 | 6x41 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 5 | 8 |
378 | 5x58 | 6x40 | nucleotide_on | 0 | 100 | Yes | Yes | No | No | 9 | 8 |
379 | 5x62 | 6x30 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 6 | 6 |
380 | 5x62 | 6x34 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 6 | 7 |
381 | 5x63 | 5x66 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 4 | 5 |
382 | 5x68 | 5x71 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 7 | 0 |
383 | 6x25 | 6x26 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 3 | 3 |
384 | 6x27 | 6x31 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 1 | 5 |
385 | 6x29 | 6x32 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 6 | 7 |
386 | 6x40 | 7x53 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
387 | 6x43 | 7x48 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | Yes | No | No | 6 | 6 |
388 | 6x48 | Lig | nucleotide_on | 0 | 100 | Yes | Yes | Yes | Yes | 8 | 0 |
389 | 6x51 | 7x41 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 6 | 7 |
390 | 6x58 | E3 | nucleotide_on | 0 | 100 | Yes | No | No | Yes | 4 | 3 |
391 | E3 | E3 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | Yes | No | Yes | 3 | 3 |
392 | 7x34 | E3 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | Yes | 4 | 3 |
393 | 7x30 | 7x33 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 4 | 4 |
394 | 7x36 | 7x39 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | Yes | 3 | 5 |
395 | 7x38 | 7x42 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | Yes | 5 | 7 |
396 | 7x42 | Lig | nucleotide_on | 0 | 100 | No | Yes | Yes | Yes | 7 | 0 |
397 | 7x52 | 7x53 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
398 | 7x54 | 8x50 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | Yes | Yes | 7 | 9 |
399 | 7x55 | 8x51 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 6 | 8 |
400 | 8x48 | 8x51 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 4 | 8 |
401 | 8x49 | I1x49 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 6 | 6 |
402 | 5x69 | 6x29 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | No | No | No | 4 | 6 |
403 | 2x53 | 2x54 | nucleotide_on | 0 | 75 | No | No | No | No | 8 | 7 |
404 | 7x32 | 7x36 | nucleotide_on | 0 | 75 | No | No | No | No | 1 | 3 |
405 | 3x44 | 5x50 | nucleotide_on | 0 | 75 | No | No | No | No | 7 | 8 |
406 | 1x50 | 2x51 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 9 | 7 |
407 | 6x54 | E3 | nucleotide_on | 0 | 56.25 | No | No | No | Yes | 4 | 3 |
408 | 3x26 | 4x61 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | Yes | 5 | 5 |
409 | 2x55 | 2x551 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 4 | 5 |
410 | 3x40 | 5x47 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | Yes | No | No | 8 | 5 |
411 | 3x29 | E2 | nucleotide_on | 0 | 75 | No | No | Yes | Yes | 4 | 3 |
412 | 2x63 | 3x28 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 3 | 6 |
413 | 7x30 | E3 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | Yes | 4 | 3 |
414 | 5x61 | 6x37 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 9 | 8 |
415 | 2x49 | 3x38 | nucleotide_on | 0 | 56.25 | No | No | No | No | 8 | 7 |
416 | 5x65 | 6x33 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 8 | 7 |
417 | 1x47 | 1x48 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 6 | 4 |
418 | 2x65 | E1x50 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 4 | 3 |
419 | 3x23 | 3x27 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 1 | 4 |
420 | 8x52 | 8x53 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | Yes | 4 | 6 |
421 | 3x34 | 4x58 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
422 | 6x39 | 7x56 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 6 | 7 |
423 | 2x63 | E2x52 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | Yes | 3 | 4 |
424 | 4x50 | 4x54 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | Yes | No | No | No | 9 | 3 |
425 | 3x48 | 5x57 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 6 | 6 |
426 | 3x21 | 3x24 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | No | 6 | 5 |
427 | 6x56 | 6x60 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | No | 5 | 4 |
428 | 6x57 | E3 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | Yes | 4 | 3 |
429 | 7x55 | 8x54 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | Yes | No | 6 | 7 |
430 | 4x63 | E2 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | Yes | Yes | 5 | 3 |
431 | 6x27 | 6x30 | nucleotide_on | 0 | 12.5 | No | No | Yes | Yes | 1 | 6 |
432 | 1x47 | 2x51 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 6 | 7 |
433 | 2x66 | E2 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | Yes | Yes | 3 | 3 |
434 | 2x66 | E1x50 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | No | No | 3 | 3 |
435 | 5x66 | 6x30 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | No | Yes | Yes | 5 | 6 |
436 | I2x55 | I2x56 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 5 | 4 |
437 | 3x52 | I2x53 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | Yes | Yes | 5 | 7 |
438 | 2x38 | I2x57 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 6 | 7 |
439 | 7x39 | 7x40 | nucleotide_on | 0 | 50 | No | Yes | No | No | 5 | 7 |
440 | 1x36 | 1x40 | nucleotide_on | 0 | 12.5 | No | No | No | No | 5 | 4 |
441 | 2x40 | 2x43 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | Yes | No | No | 8 | 8 |
442 | 6x31 | 6x35 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 7 |
443 | 6x45 | 6x49 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 6 | 7 |
444 | 6x43 | 7x52 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | Yes | No | No | 6 | 8 |
445 | 3x54 | 5x65 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 9 | 8 |
446 | 5x61 | 5x65 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 9 | 8 |
447 | 5x62 | 6x37 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 6 | 8 |
448 | I2x52 | I2x56 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | No | 5 | 4 |
449 | 5x69 | 6x30 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | Yes | Yes | 4 | 6 |
450 | 5x64 | 5x67 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
451 | 1x32 | NT | nucleotide_on | 0 | 0 | No | Yes | Yes | No | 4 | 0 |
452 | 1x33 | 7x35 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | Yes | 5 | 3 |
453 | 5x73 | 6x26 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | No | 0 | 3 |
454 | 6x42 | 6x43 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | Yes | 5 | 6 |
455 | 1x55 | 1x58 | nucleotide_on | 0 | 0 | Yes | No | No | No | 4 | 3 |
456 | 1x52 | 1x55 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | Yes | No | 7 | 4 |
457 | 4x40 | 4x43 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | No | 5 | 1 |
458 | 1x57 | I1x51 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 8 | 7 |
459 | 4x39 | 4x42 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 3 | 7 |
460 | 6x25 | 6x28 | nucleotide_on | 0 | 25 | No | No | No | No | 3 | 3 |
461 | 5x70 | 6x26 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 0 | 3 |
462 | 1x30 | 1x31 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 4 |
463 | 4x55 | 4x56 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | Yes | 4 | 5 |
464 | 1x54 | 2x48 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 7 | 6 |
465 | 1x40 | 1x44 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 4 | 5 |
466 | 6x53 | 6x57 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 6 | 4 |
467 | 1x38 | 1x41 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 5 |
468 | 1x41 | 1x42 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 7 |
469 | 8x53 | 8x57 | nucleotide_on | 0 | 12.5 | No | Yes | No | No | 6 | 7 |
470 | 4x44 | 4x47 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 3 | 4 |
471 | 8x52 | 8x56 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 4 | 5 |
472 | 5x73 | I3 | nucleotide_on | 0 | 12.5 | No | No | No | No | 0 | 4 |
473 | 5x56 | 5x60 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 4 | 4 |
474 | 5x67 | 5x71 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 4 | 0 |
475 | 5x69 | 5x72 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 4 | 0 |
476 | 4x43 | 4x44 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 1 | 3 |
477 | 1x27 | 2x65 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | No | No | No | 0 | 4 |
478 | 4x61 | 4x62 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | No | Yes | No | No | 5 | 4 |
479 | 8x55 | 8x58 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 5 | 5 |
480 | 1x28 | 1x33 | nucleotide_on | 0 | 0 | No | No | No | No | 0 | 5 |
Index: hub id, click on each number to highlight the corresponding hub in the 3D visualization.
Hub: the hub being considered.
Owner: the name of the network the hub belong to or "Shared" if the corresponding hub is present in both networks.
Avg Int. Strength: the average interaction strength of all the links of the corresponding hub in the corresponding network.
Num Of Links: the number of links of the corresponding hub in the corresponding network.
ConSurf: this column reports the ConSurf conservation grades of each hub.
Index | Hub | Owner | nucleotide_off Avg Int. Strength | nucleotide_on Avg Int. Strength | nucleotide_off Num Of Links | nucleotide_on Num Of Links | ConSurf |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1x55 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 3 | 4 |
2 | 2x41 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 1 | 4 |
3 | 2x44 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 2 | 5 |
4 | 2x64 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 3 | 3 |
5 | 3x49 | nucleotide_off | 17.5 | 0 | 5 | 3 | 9 |
6 | 3x50 | nucleotide_off | 42.5 | 0 | 5 | 3 | 9 |
7 | 3x51 | nucleotide_off | 37.5 | 0 | 4 | 3 | 7 |
8 | 4x50 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 2 | 9 |
9 | 6x55 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 3 | 5 |
10 | 6x58 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 1 | 4 |
11 | 6x59 | nucleotide_off | 32.5 | 0 | 4 | 3 | 4 |
12 | 7x45 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 3 | 9 |
13 | 8x54 | nucleotide_off | 0 | 0 | 4 | 2 | 7 |
14 | NT | nucleotide_off | 50 | 0 | 7 | 1 | 0 |
15 | 1x35 | Shared | 12.5 | 93.75 | 4 | 5 | 5 |
16 | 1x39 | Shared | 75 | 93.75 | 6 | 4 | 6 |
17 | 2x42 | Shared | 0 | 0 | 5 | 5 | 8 |
18 | 2x57 | Shared | 45 | 100 | 4 | 4 | 6 |
19 | 3x37 | Shared | 75 | 0 | 6 | 4 | 6 |
20 | I2x53 | Shared | 0 | 50 | 4 | 5 | 7 |
21 | E2 | Shared | 75 | 100 | 16 | 18 | 3 |
22 | 5x39 | Shared | 50 | 100 | 5 | 7 | 6 |
23 | 5x44 | Shared | 37.5 | 75 | 4 | 4 | 5 |
24 | 5x461 | Shared | 25 | 50 | 4 | 5 | 8 |
25 | 5x58 | Shared | 50 | 100 | 6 | 6 | 9 |
26 | 6x30 | Shared | 0 | 0 | 4 | 4 | 6 |
27 | 6x44 | Shared | 50 | 37.5 | 4 | 5 | 9 |
28 | 6x48 | Shared | 35 | 100 | 5 | 5 | 8 |
29 | 7x49 | Shared | 20 | 93.75 | 5 | 4 | 9 |
30 | 7x53 | Shared | 85 | 93.75 | 6 | 5 | 9 |
31 | 8x50 | Shared | 35 | 43.75 | 5 | 6 | 9 |
32 | Lig | Shared | 100 | 100 | 11 | 11 | 0 |
33 | 1x32 | nucleotide_on | 0 | 0 | 3 | 4 | 4 |
34 | I1x50 | nucleotide_on | 17.5 | 43.75 | 2 | 5 | 8 |
35 | 2x40 | nucleotide_on | 10 | 75 | 3 | 6 | 8 |
36 | 2x46 | nucleotide_on | 0 | 0 | 1 | 4 | 9 |
37 | 2x50 | nucleotide_on | 20 | 100 | 3 | 5 | 9 |
38 | 3x40 | nucleotide_on | 0 | 50 | 2 | 4 | 8 |
39 | 3x43 | nucleotide_on | 0 | 31.25 | 1 | 4 | 8 |
40 | 4x56 | nucleotide_on | 0 | 6.25 | 2 | 4 | 5 |
41 | 4x61 | nucleotide_on | 0 | 0 | 2 | 4 | 5 |
42 | E2x52 | nucleotide_on | 0 | 0 | 3 | 4 | 4 |
43 | 5x40 | nucleotide_on | 40 | 43.75 | 2 | 4 | 5 |
44 | 5x42 | nucleotide_on | 0 | 75 | 2 | 4 | 5 |
45 | 6x43 | nucleotide_on | 0 | 0 | 1 | 4 | 6 |
46 | E3 | nucleotide_on | 22.5 | 68.75 | 3 | 8 | 3 |
47 | 7x35 | nucleotide_on | 0 | 50 | 3 | 5 | 3 |
48 | 7x39 | nucleotide_on | 0 | 50 | 3 | 5 | 5 |
49 | 7x42 | nucleotide_on | 40 | 93.75 | 2 | 5 | 7 |
50 | 8x53 | nucleotide_on | 0 | 0 | 2 | 4 | 6 |
Index: link id, click on each number to highlight the corresponding link in the 3D visualization.
Node1 Node2: the two nodes of the corresponding link.
Owner: the name of the network the link belong to or "Shared" if the corresponding link is present in both networks.
Recurrence: the relative Recurrence in the filtered pool of shortest paths.
Hub1?, Hub2?: "Yes" if the corresponding node has more than 3 links, otherwise "No".
ConSurf1, ConSurf2: these columns report the ConSurf conservation grades of the two nodes involved in a link.
Index | Node1 | Node2 | Owner | nucleotide_off Recurrence | nucleotide_on Recurrence | nucleotide_off Hub1? | nucleotide_on Hub1? | nucleotide_off Hub2? | nucleotide_on Hub2? | ConSurf1 | ConSurf2 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1x35 | 1x39 | nucleotide_off | 38.3514 | 1.09402 | Yes | Yes | Yes | Yes | 5 | 6 |
2 | 1x39 | 7x39 | nucleotide_off | 17.8462 | 0 | Yes | Yes | No | Yes | 6 | 5 |
3 | 1x35 | 2x64 | nucleotide_off | 10.7384 | 4.42013 | Yes | Yes | Yes | No | 5 | 3 |
4 | 1x42 | 7x39 | nucleotide_off | 11.4509 | 5.18742 | No | No | No | Yes | 7 | 5 |
5 | 1x35 | 7x35 | nucleotide_off | 53.2999 | 7.9555 | Yes | Yes | No | Yes | 5 | 3 |
6 | 7x31 | 7x35 | nucleotide_off | 55.6044 | 1.28492 | No | No | No | Yes | 3 | 3 |
7 | 7x31 | NT | nucleotide_off | 56.5112 | 0 | No | No | Yes | No | 3 | 0 |
8 | Lig | NT | nucleotide_off | 66.4451 | 0 | Yes | Yes | Yes | No | 0 | 0 |
9 | 5x39 | E2 | nucleotide_off | 51.4011 | 1.351 | Yes | Yes | Yes | Yes | 6 | 3 |
10 | 5x39 | 5x43 | nucleotide_off | 53.4329 | 0.201916 | Yes | Yes | No | No | 6 | 5 |
11 | 3x37 | 5x43 | nucleotide_off | 53.7431 | 0 | Yes | Yes | No | No | 6 | 5 |
12 | 3x36 | 3x37 | nucleotide_off | 100 | 0 | No | No | Yes | Yes | 6 | 6 |
13 | 3x36 | 6x48 | nucleotide_off | 99.7307 | 0 | No | No | Yes | Yes | 6 | 8 |
14 | 6x55 | Lig | nucleotide_off | 43.9149 | 8.53188 | Yes | No | Yes | Yes | 5 | 0 |
15 | 5x44 | 6x55 | nucleotide_off | 47.5285 | 0 | Yes | Yes | Yes | No | 5 | 5 |
16 | 5x44 | 6x52 | nucleotide_off | 47.2728 | 0.0110136 | Yes | Yes | No | No | 5 | 7 |
17 | 3x37 | 6x52 | nucleotide_off | 51.4045 | 0 | Yes | Yes | No | No | 6 | 7 |
18 | 7x49 | 7x53 | nucleotide_off | 89.6264 | 0 | Yes | Yes | Yes | Yes | 9 | 9 |
19 | 7x53 | 8x50 | nucleotide_off | 25.8301 | 0 | Yes | Yes | Yes | Yes | 9 | 9 |
20 | 8x50 | 8x54 | nucleotide_off | 17.4371 | 0 | Yes | Yes | Yes | No | 9 | 7 |
21 | 1x57 | 7x53 | nucleotide_off | 21.8995 | 0 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
22 | 1x57 | 2x44 | nucleotide_off | 12.7088 | 7.41217 | No | No | Yes | No | 8 | 5 |
23 | 2x43 | 7x53 | nucleotide_off | 57.5748 | 0 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
24 | 2x39 | 2x43 | nucleotide_off | 56.7839 | 0 | No | No | No | No | 8 | 8 |
25 | 2x39 | 3x50 | nucleotide_off | 43.1206 | 0 | No | No | Yes | No | 8 | 9 |
26 | 2x45 | 4x50 | nucleotide_off | 13.5031 | 0 | No | No | Yes | No | 9 | 9 |
27 | 3x50 | 6x30 | nucleotide_off | 43.1479 | 0 | Yes | No | Yes | Yes | 9 | 6 |
28 | 3x54 | 6x30 | nucleotide_off | 38.5184 | 0 | No | No | Yes | Yes | 9 | 6 |
29 | 3x54 | 5x61 | nucleotide_off | 37.506 | 9.55248 | No | No | No | No | 9 | 9 |
30 | 3x51 | 5x61 | nucleotide_off | 36.4867 | 0 | Yes | No | No | No | 7 | 9 |
31 | 3x51 | 5x57 | nucleotide_off | 25.6801 | 7.88208 | Yes | No | No | No | 7 | 6 |
32 | 7x54 | 8x54 | nucleotide_off | 13.8917 | 0 | No | No | Yes | No | 7 | 7 |
33 | 7x54 | 7x55 | nucleotide_off | 12.7361 | 0 | No | No | No | No | 7 | 6 |
34 | 6x36 | 7x55 | nucleotide_off | 10.377 | 0 | No | No | No | No | 8 | 6 |
35 | E2 | Lig | Shared | 44.1876 | 56.5256 | Yes | Yes | Yes | Yes | 3 | 0 |
36 | 6x48 | 7x45 | Shared | 95.9296 | 41.1469 | Yes | Yes | Yes | No | 8 | 9 |
37 | 7x45 | 7x49 | Shared | 96.424 | 40.5301 | Yes | No | Yes | Yes | 9 | 9 |
38 | 2x50 | 7x49 | Shared | 15.4258 | 21.1425 | No | Yes | Yes | Yes | 9 | 9 |
39 | 2x39 | 3x49 | Shared | 12.7395 | 60.674 | No | No | Yes | No | 8 | 9 |
40 | 3x37 | 4x53 | Shared | 31.83 | 19.7915 | Yes | Yes | No | No | 6 | 8 |
41 | 3x38 | 4x53 | Shared | 26.3926 | 17.3428 | No | No | No | No | 7 | 8 |
42 | 3x38 | 4x50 | Shared | 25.2847 | 12.4234 | No | No | Yes | No | 7 | 9 |
43 | 2x45 | 4x46 | Shared | 12.6474 | 97.2686 | No | No | No | No | 9 | 8 |
44 | 2x42 | 4x46 | Shared | 11.4577 | 95.8919 | Yes | Yes | No | No | 8 | 8 |
45 | 3x47 | 5x57 | Shared | 24.5619 | 11.7809 | No | No | No | No | 9 | 6 |
46 | 3x47 | 5x58 | Shared | 20.0211 | 13.7193 | No | No | Yes | Yes | 9 | 9 |
47 | 1x35 | 7x39 | nucleotide_on | 0 | 14.6995 | Yes | Yes | No | Yes | 5 | 5 |
48 | 1x35 | 7x38 | nucleotide_on | 0 | 25.838 | Yes | Yes | No | No | 5 | 5 |
49 | 7x38 | Lig | nucleotide_on | 1.45224 | 26.6897 | No | No | Yes | Yes | 5 | 0 |
50 | 6x48 | Lig | nucleotide_on | 0 | 97.3788 | Yes | Yes | Yes | Yes | 8 | 0 |
51 | 2x50 | 7x46 | nucleotide_on | 9.47706 | 20.6322 | No | Yes | No | No | 9 | 9 |
52 | 1x50 | 2x50 | nucleotide_on | 4.98739 | 13.231 | No | No | No | Yes | 9 | 9 |
53 | 6x44 | 6x48 | nucleotide_on | 2.34881 | 55.2663 | Yes | Yes | Yes | Yes | 9 | 8 |
54 | 3x43 | 6x44 | nucleotide_on | 1.25452 | 61.0118 | No | Yes | Yes | Yes | 8 | 9 |
55 | 2x46 | 3x43 | nucleotide_on | 0 | 77.4111 | No | Yes | No | Yes | 9 | 8 |
56 | 2x46 | 3x42 | nucleotide_on | 0 | 100 | No | Yes | No | No | 9 | 8 |
57 | 2x45 | 3x42 | nucleotide_on | 0.323856 | 98.638 | No | No | No | No | 9 | 8 |
58 | 2x42 | 3x49 | nucleotide_on | 0 | 78.7107 | Yes | Yes | Yes | No | 8 | 9 |
59 | 2x37 | 2x39 | nucleotide_on | 0 | 58.8862 | No | No | No | No | 7 | 8 |
60 | 2x37 | 2x40 | nucleotide_on | 1.25452 | 57.2782 | No | No | No | Yes | 7 | 8 |
61 | 2x40 | I1x50 | nucleotide_on | 6.61349 | 34.7149 | No | Yes | No | Yes | 8 | 8 |
62 | 8x53 | I1x50 | nucleotide_on | 0 | 28.0664 | No | Yes | No | Yes | 6 | 8 |
63 | 8x52 | 8x53 | nucleotide_on | 0 | 25.3534 | No | No | No | Yes | 4 | 6 |
64 | 8x48 | 8x52 | nucleotide_on | 1.25452 | 18.9912 | No | No | No | No | 4 | 4 |
65 | 8x48 | 8x51 | nucleotide_on | 0 | 17.1959 | No | No | No | No | 4 | 8 |
66 | 7x55 | 8x51 | nucleotide_on | 0 | 12.5372 | No | No | No | No | 6 | 8 |
67 | 2x46 | 7x49 | nucleotide_on | 1.25452 | 29.9607 | No | Yes | Yes | Yes | 9 | 9 |
68 | 1x57 | 2x40 | nucleotide_on | 9.04411 | 12.8969 | No | No | No | Yes | 8 | 8 |
69 | 3x49 | I2x53 | nucleotide_on | 3.30674 | 19.5602 | Yes | No | Yes | Yes | 9 | 7 |
70 | 2x53 | 7x46 | nucleotide_on | 8.26686 | 13.231 | No | No | No | No | 8 | 9 |
71 | 5x42 | E2 | nucleotide_on | 0 | 34.6305 | No | Yes | Yes | Yes | 5 | 3 |
72 | 4x56 | 5x42 | nucleotide_on | 0 | 15.8413 | No | Yes | No | Yes | 5 | 5 |
73 | 3x37 | 4x56 | nucleotide_on | 1.24429 | 13.4843 | Yes | Yes | No | Yes | 6 | 5 |
74 | 5x42 | 5x461 | nucleotide_on | 1.50337 | 19.3509 | No | Yes | Yes | Yes | 5 | 8 |
75 | 3x37 | 5x461 | nucleotide_on | 1.82723 | 13.6055 | Yes | Yes | Yes | Yes | 6 | 8 |
76 | 3x43 | 7x53 | nucleotide_on | 0 | 41.3965 | No | Yes | Yes | Yes | 8 | 9 |
77 | 5x54 | 6x44 | nucleotide_on | 0 | 38.1512 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
78 | 5x54 | 5x58 | nucleotide_on | 0 | 37.3692 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
79 | 3x52 | I2x53 | nucleotide_on | 0 | 11.6708 | No | No | Yes | Yes | 5 | 7 |
80 | 5x58 | 6x37 | nucleotide_on | 2.14768 | 50.2001 | Yes | Yes | No | No | 9 | 8 |
81 | 5x61 | 6x37 | nucleotide_on | 0 | 15.129 | No | No | No | No | 9 | 8 |
82 | 2x42 | 4x42 | nucleotide_on | 6.63053 | 16.1717 | Yes | Yes | No | No | 8 | 7 |
83 | 4x39 | 4x42 | nucleotide_on | 0 | 12.6657 | No | No | No | No | 3 | 7 |
84 | 4x38 | 4x39 | nucleotide_on | 0 | 10.8778 | No | No | No | No | 8 | 3 |
85 | 6x40 | 7x53 | nucleotide_on | 0 | 17.3685 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
86 | 5x58 | 6x40 | nucleotide_on | 0 | 17.0785 | Yes | Yes | No | No | 9 | 8 |
87 | 5x62 | 6x37 | nucleotide_on | 0 | 34.5167 | No | No | No | No | 6 | 8 |
88 | 5x62 | 6x30 | nucleotide_on | 0 | 31.0731 | No | No | Yes | Yes | 6 | 6 |
89 | 5x66 | 6x30 | nucleotide_on | 0 | 16.748 | No | No | Yes | Yes | 5 | 6 |
90 | 5x66 | 5x70 | nucleotide_on | 1.75905 | 12.9006 | No | No | No | No | 5 | 0 |
91 | 5x70 | 6x26 | nucleotide_on | 0 | 10.9512 | No | No | No | No | 0 | 3 |
92 | 7x52 | 7x53 | nucleotide_on | 0 | 10.0261 | No | No | Yes | Yes | 8 | 9 |
93 | 7x34 | Lig | nucleotide_on | 1.14543 | 10.1619 | No | No | Yes | Yes | 4 | 0 |
94 | 3x50 | 7x53 | nucleotide_on | 0 | 17.1959 | Yes | No | Yes | Yes | 9 | 9 |
95 | 3x50 | 5x58 | nucleotide_on | 0 | 16.983 | Yes | No | Yes | Yes | 9 | 9 |
96 | 7x42 | Lig | nucleotide_on | 0 | 12.3646 | No | Yes | Yes | Yes | 7 | 0 |
97 | 2x46 | 2x50 | nucleotide_on | 0 | 15.7091 | No | Yes | No | Yes | 9 | 9 |
98 | 3x43 | 7x49 | nucleotide_on | 0 | 11.5019 | No | Yes | Yes | Yes | 8 | 9 |
Here, those paths that begin and end at given residue pair(s) or that pass through a residue are used to generate a novel metapath. Such a path filtering is particularly recommended if some information on allosteric residues is available. The selection syntax for a residue pair ("Pairs") is C:C:c534,A:A:?600 (the lower-case "c" stands for cytosine and "?" indicates any non standard amino acid or nucleotide residue). Selection of more than one apical residue pair has the following syntax: C:C:c534,A:A:?600,C:C:c534,A:A:E41. Only one residue can be selected as a tail ("Tail"). For midway residue(s), each residue must be separated by a comma as well e.g. A:A:?600,A:A:E41.
2D representation of the global metapath, ligand(s) interactions and
histograms of path distribution according to several parameters
(click on the image to enlarge it 🔍):
2D representation of the interactions of this orthosteric/allosteric ligand. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Location and physicochemical properties of the interaction partners of this ligand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions of this ligand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
You can download a compressed (zip) file with structure(s), 3D outputs (as PyMol and VMD scripts) and numerical data files (as csv and plain text files).
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