Show | PDB | Class | SubFamily | Type | SubType | Species | Orthosteric Ligand | Other Ligand(s) | Protein Partners | Resolution | Date | DOI |
| 7F1O | A | Amine | Dopamine | D1 | Homo sapiens | Dopamine | GDP; Mg | Gs/Beta1/Gamma2 | 3.13 | 2022-06-15 | 10.1126/sciadv.abo4158 |
![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7F1O_W_W_1.png)
A 2D representation of the interactions of GDP in 7F1O colored according to ConSurf Conservation Grade (See documentation):
(Click to enlarge 🔍) | Node1 | Node2 | LinkStrength | Comm | IsNode1Hub? | IsNode2Hub? | Node1Cons | Node2Cons | Node1Shell | Node2Shell | A:A:K53 | A:A:L45 | 5.64 | 0 | No | No | 9 | 8 | 1 | 2 | A:A:D223 | A:A:L45 | 4.07 | 0 | No | No | 9 | 8 | 2 | 2 | A:A:G52 | A:A:S51 | 3.71 | 2 | No | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:G52 | A:A:T55 | 3.64 | 2 | No | No | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:G52 | W:W:?1 | 4.62 | 2 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:K53 | W:W:?1 | 6.1 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:S54 | M:M:?1 | 5.77 | 2 | No | No | 9 | 0 | 1 | 1 | A:A:S54 | W:W:?1 | 9.74 | 2 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:T55 | W:W:?1 | 9.56 | 2 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D223 | M:M:?1 | 5.21 | 0 | No | No | 9 | 0 | 2 | 1 | A:A:D249 | A:A:S251 | 5.89 | 2 | No | No | 8 | 9 | 2 | 2 | A:A:D249 | A:A:K293 | 19.36 | 2 | No | Yes | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:K293 | A:A:S251 | 4.59 | 2 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:L296 | A:A:S251 | 6.01 | 0 | No | No | 6 | 9 | 2 | 2 | A:A:K293 | A:A:N292 | 5.6 | 2 | Yes | Yes | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:N292 | A:A:T364 | 5.85 | 2 | Yes | Yes | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:A366 | A:A:N292 | 4.69 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:N292 | W:W:?1 | 4.45 | 2 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:K293 | W:W:?1 | 22.1 | 2 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D295 | A:A:L296 | 5.43 | 0 | No | No | 9 | 6 | 1 | 2 | A:A:C365 | A:A:D295 | 6.22 | 0 | No | No | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:D295 | W:W:?1 | 7.34 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | M:M:?1 | W:W:?1 | 7.19 | 2 | No | Yes | 0 | 0 | 1 | 0 | A:A:Q59 | A:A:T55 | 2.83 | 0 | No | No | 9 | 9 | 2 | 1 | |
Statistics | Value |
---|
Average Number Of Links | 8.00 | Average Number Of Links With An Hub | 2.00 | Average Interaction Strength | 8.89 | Average Nodes In Shell | 19.00 | Average Hubs In Shell | 4.00 | Average Links In Shell | 24.00 | Average Links Mediated by Hubs In Shell | 13.00 |
| ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7F1O_W_W_1_res_stats.svg) Physico-chemical properties of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) | ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7F1O_W_W_1_pos_stats.svg) Location of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) |
|
Show | PDB | Class | SubFamily | Type | SubType | Species | Orthosteric Ligand | Other Ligand(s) | Protein Partners | Resolution | Date | DOI |
| 7F1Z | A | Amine | Dopamine | D1 | Homo sapiens | Dopamine | GDP | Gs/Beta1/Gamma2 | 3.46 | 2022-06-15 | 10.1126/sciadv.abo4158 |
![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7F1Z_W_W_1.png)
A 2D representation of the interactions of GDP in 7F1Z colored according to ConSurf Conservation Grade (See documentation):
(Click to enlarge 🔍) | Node1 | Node2 | LinkStrength | Comm | IsNode1Hub? | IsNode2Hub? | Node1Cons | Node2Cons | Node1Shell | Node2Shell | A:A:K53 | A:A:L45 | 7.05 | 2 | Yes | Yes | 9 | 8 | 1 | 2 | A:A:D223 | A:A:L45 | 5.43 | 2 | No | Yes | 9 | 8 | 2 | 2 | A:A:D49 | W:W:?1 | 4.4 | 0 | No | Yes | 8 | 0 | 1 | 0 | A:A:D249 | A:A:N50 | 6.73 | 2 | Yes | Yes | 8 | 9 | 2 | 2 | A:A:K293 | A:A:N50 | 2.8 | 2 | Yes | Yes | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:G52 | A:A:T55 | 5.46 | 0 | No | No | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:D223 | A:A:K53 | 12.44 | 2 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:K53 | A:A:V247 | 3.04 | 2 | Yes | Yes | 9 | 7 | 1 | 2 | A:A:K53 | W:W:?1 | 8.38 | 2 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:S54 | W:W:?1 | 9.74 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:A366 | A:A:T55 | 3.36 | 2 | No | No | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:T55 | W:W:?1 | 11.95 | 2 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:N292 | A:A:V247 | 4.43 | 2 | Yes | Yes | 9 | 7 | 1 | 2 | A:A:D249 | A:A:S251 | 4.42 | 2 | Yes | No | 8 | 9 | 2 | 2 | A:A:D249 | A:A:K293 | 16.59 | 2 | Yes | Yes | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:K293 | A:A:S251 | 4.59 | 2 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:L296 | A:A:S251 | 6.01 | 2 | Yes | No | 6 | 9 | 1 | 2 | A:A:K293 | A:A:N292 | 4.2 | 2 | Yes | Yes | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:N292 | A:A:T364 | 7.31 | 2 | Yes | Yes | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:N292 | W:W:?1 | 5.2 | 2 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:K293 | A:A:L296 | 5.64 | 2 | Yes | Yes | 9 | 6 | 1 | 1 | A:A:K293 | W:W:?1 | 27.44 | 2 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D295 | A:A:L296 | 6.79 | 2 | No | Yes | 9 | 6 | 1 | 1 | A:A:C365 | A:A:D295 | 6.22 | 0 | No | No | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:D295 | W:W:?1 | 4.4 | 2 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:E299 | A:A:L296 | 3.98 | 0 | No | Yes | 6 | 6 | 2 | 1 | A:A:L296 | W:W:?1 | 5.99 | 2 | Yes | Yes | 6 | 0 | 1 | 0 | A:A:A366 | W:W:?1 | 4.26 | 2 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:G206 | A:A:S54 | 1.86 | 0 | No | No | 8 | 9 | 2 | 1 | |
Statistics | Value |
---|
Average Number Of Links | 9.00 | Average Number Of Links With An Hub | 4.00 | Average Interaction Strength | 9.08 | Average Nodes In Shell | 21.00 | Average Hubs In Shell | 10.00 | Average Links In Shell | 29.00 | Average Links Mediated by Hubs In Shell | 25.00 |
| ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7F1Z_W_W_1_res_stats.svg) Physico-chemical properties of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) | ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7F1Z_W_W_1_pos_stats.svg) Location of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) |
|
Show | PDB | Class | SubFamily | Type | SubType | Species | Orthosteric Ligand | Other Ligand(s) | Protein Partners | Resolution | Date | DOI |
| 7RKF | A | Other | Unclassified | US28 | Human betaherpesvirus 5 | Fractalkine | GDP | chim(NtGi1-G11)/Beta1/Gamma2 | 4 | 2022-01-26 | 10.1126/sciadv.abl5442 |
![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7RKF_N_N_1.png)
A 2D representation of the interactions of GDP in 7RKF colored according to ConSurf Conservation Grade (See documentation):
(Click to enlarge 🔍) | Node1 | Node2 | LinkStrength | Comm | IsNode1Hub? | IsNode2Hub? | Node1Cons | Node2Cons | Node1Shell | Node2Shell | A:A:G48 | A:A:T47 | 3.64 | 0 | No | No | 7 | 8 | 1 | 2 | A:A:E49 | A:A:G48 | 4.91 | 13 | No | No | 9 | 7 | 2 | 1 | A:A:G51 | N:N:?1 | 6.47 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D205 | A:A:K52 | 2.77 | 5 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:G207 | A:A:K52 | 3.49 | 5 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:K52 | N:N:?1 | 8.38 | 5 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:S53 | N:N:?1 | 4.87 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:Q58 | A:A:T54 | 4.25 | 0 | No | No | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:T54 | N:N:?1 | 3.98 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D155 | A:A:K275 | 6.91 | 0 | No | No | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:D155 | A:A:L278 | 4.07 | 0 | No | No | 8 | 5 | 2 | 1 | A:A:R181 | A:A:S156 | 7.91 | 5 | Yes | No | 6 | 9 | 1 | 1 | A:A:S156 | N:N:?1 | 3.25 | 5 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:Y159 | A:A:Y160 | 1.99 | 5 | Yes | No | 9 | 7 | 2 | 2 | A:A:R181 | A:A:Y159 | 4.12 | 5 | Yes | Yes | 6 | 9 | 1 | 2 | A:A:R181 | A:A:Y160 | 2.06 | 5 | Yes | No | 6 | 7 | 1 | 2 | A:A:R181 | A:A:T332 | 7.76 | 5 | Yes | No | 6 | 8 | 1 | 1 | A:A:R181 | N:N:?1 | 6.57 | 5 | Yes | Yes | 6 | 0 | 1 | 0 | A:A:R183 | N:N:?1 | 8.54 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D205 | A:A:G207 | 3.35 | 5 | No | No | 9 | 9 | 2 | 2 | A:A:L278 | A:A:S233 | 3 | 0 | No | No | 5 | 9 | 1 | 2 | A:A:A331 | A:A:N274 | 4.69 | 0 | No | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:K275 | N:N:?1 | 9.91 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:C330 | A:A:K276 | 3.23 | 0 | No | No | 8 | 5 | 1 | 2 | A:A:L278 | N:N:?1 | 2.24 | 0 | No | Yes | 5 | 0 | 1 | 0 | A:A:C330 | N:N:?1 | 2.57 | 0 | No | Yes | 8 | 0 | 1 | 0 | A:A:A331 | N:N:?1 | 4.26 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:T332 | N:N:?1 | 9.56 | 5 | No | Yes | 8 | 0 | 1 | 0 | A:A:G48 | N:N:?1 | 1.85 | 0 | No | Yes | 7 | 0 | 1 | 0 | A:A:G46 | A:A:K52 | 1.74 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:C330 | A:A:D277 | 1.56 | 0 | No | No | 8 | 9 | 1 | 2 | |
Statistics | Value |
---|
Average Number Of Links | 13.00 | Average Number Of Links With An Hub | 2.00 | Average Interaction Strength | 5.57 | Average Nodes In Shell | 27.00 | Average Hubs In Shell | 4.00 | Average Links In Shell | 31.00 | Average Links Mediated by Hubs In Shell | 21.00 |
| ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7RKF_N_N_1_res_stats.svg) Physico-chemical properties of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) | ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7RKF_N_N_1_pos_stats.svg) Location of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) |
|
Show | PDB | Class | SubFamily | Type | SubType | Species | Orthosteric Ligand | Other Ligand(s) | Protein Partners | Resolution | Date | DOI |
| 7VUJ | A | Orphan | A orphans | GPR139 | Homo sapiens | JNJ-63533054 | GDP | chim(Gs-CtGq)/Beta1/Gamma2 | 3.8 | 2021-12-29 | 10.1038/s41422-021-00591-w |
![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7VUJ_M_M_1.png)
A 2D representation of the interactions of GDP in 7VUJ colored according to ConSurf Conservation Grade (See documentation):
(Click to enlarge 🔍) | Node1 | Node2 | LinkStrength | Comm | IsNode1Hub? | IsNode2Hub? | Node1Cons | Node2Cons | Node1Shell | Node2Shell | A:A:K53 | A:A:L45 | 4.23 | 0 | Yes | No | 9 | 8 | 1 | 2 | A:A:N50 | A:A:R265 | 3.62 | 0 | No | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:K53 | A:A:S51 | 7.65 | 0 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:G52 | M:M:?1 | 4.62 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D223 | A:A:K53 | 5.53 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:K53 | M:M:?1 | 3.81 | 0 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D223 | A:A:S54 | 7.36 | 0 | No | No | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:S54 | M:M:?1 | 5.68 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:T55 | M:M:?1 | 16.73 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:I56 | A:A:N292 | 9.91 | 0 | No | Yes | 7 | 9 | 2 | 1 | A:A:N292 | A:A:V247 | 4.43 | 17 | Yes | No | 9 | 7 | 1 | 2 | A:A:D249 | A:A:K293 | 8.3 | 0 | No | No | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:A366 | A:A:N292 | 4.69 | 17 | No | Yes | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:N292 | M:M:?1 | 3.71 | 17 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:K293 | A:A:L296 | 8.46 | 0 | No | No | 9 | 6 | 1 | 2 | A:A:K293 | M:M:?1 | 22.87 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D295 | A:A:L296 | 6.79 | 0 | No | No | 9 | 6 | 1 | 2 | A:A:D295 | M:M:?1 | 11 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:A366 | M:M:?1 | 5.96 | 17 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:N50 | M:M:?1 | 1.48 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:Q59 | A:A:T55 | 1.42 | 0 | No | No | 9 | 9 | 2 | 1 | |
Statistics | Value |
---|
Average Number Of Links | 9.00 | Average Number Of Links With An Hub | 2.00 | Average Interaction Strength | 8.43 | Average Nodes In Shell | 19.00 | Average Hubs In Shell | 3.00 | Average Links In Shell | 21.00 | Average Links Mediated by Hubs In Shell | 15.00 |
| ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7VUJ_M_M_1_res_stats.svg) Physico-chemical properties of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) | ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_7VUJ_M_M_1_pos_stats.svg) Location of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) |
|
Show | PDB | Class | SubFamily | Type | SubType | Species | Orthosteric Ligand | Other Ligand(s) | Protein Partners | Resolution | Date | DOI |
| 8IYS | A | Lipid | Free fatty acid | FFA4 | Homo sapiens | TUG-891 | GDP | chim(NtGi1L-Gq)/Beta1/Gamma2 | 2.95 | 2023-06-21 | 10.1038/s41422-023-00835-x |
![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8IYS_N_N_1.png)
A 2D representation of the interactions of GDP in 8IYS colored according to ConSurf Conservation Grade (See documentation):
(Click to enlarge 🔍) | Node1 | Node2 | LinkStrength | Comm | IsNode1Hub? | IsNode2Hub? | Node1Cons | Node2Cons | Node1Shell | Node2Shell | A:A:K52 | A:A:L44 | 7.05 | 0 | Yes | No | 9 | 8 | 1 | 2 | A:A:G51 | N:N:?1 | 5.55 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D205 | A:A:K52 | 8.3 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:K52 | N:N:?1 | 7.62 | 0 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:R183 | A:A:S53 | 3.95 | 11 | No | No | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:S53 | N:N:?1 | 6.49 | 11 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:T54 | N:N:?1 | 7.17 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D155 | A:A:K275 | 9.68 | 11 | No | Yes | 8 | 9 | 1 | 1 | A:A:D155 | A:A:L278 | 4.07 | 11 | No | Yes | 8 | 5 | 1 | 1 | A:A:D155 | N:N:?1 | 4.4 | 11 | No | Yes | 8 | 0 | 1 | 0 | A:A:R181 | A:A:S156 | 9.22 | 6 | Yes | No | 6 | 9 | 2 | 1 | A:A:S156 | N:N:?1 | 4.06 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:R181 | A:A:T332 | 5.17 | 6 | Yes | No | 6 | 9 | 2 | 1 | A:A:R183 | N:N:?1 | 11.82 | 11 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:L229 | A:A:N274 | 4.12 | 2 | No | Yes | 7 | 9 | 2 | 1 | A:A:A231 | A:A:K275 | 4.82 | 0 | No | Yes | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:K275 | A:A:S233 | 7.65 | 11 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:L278 | A:A:S233 | 6.01 | 11 | Yes | No | 5 | 9 | 1 | 2 | A:A:N274 | A:A:T329 | 4.39 | 0 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:A331 | A:A:N274 | 4.69 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:N274 | N:N:?1 | 8.16 | 0 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:K275 | A:A:L278 | 4.23 | 11 | Yes | Yes | 9 | 5 | 1 | 1 | A:A:K275 | N:N:?1 | 20.58 | 11 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D277 | A:A:L278 | 5.43 | 11 | Yes | Yes | 9 | 5 | 1 | 1 | A:A:C330 | A:A:D277 | 6.22 | 0 | No | Yes | 7 | 9 | 2 | 1 | A:A:D277 | N:N:?1 | 8.07 | 11 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:L278 | N:N:?1 | 5.24 | 11 | Yes | Yes | 5 | 0 | 1 | 0 | A:A:T332 | N:N:?1 | 13.55 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:S154 | A:A:S156 | 3.26 | 0 | No | No | 7 | 9 | 2 | 1 | A:A:K52 | A:A:S50 | 3.06 | 0 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:D277 | A:A:E281 | 1.3 | 11 | Yes | No | 9 | 5 | 1 | 2 | |
Statistics | Value |
---|
Average Number Of Links | 12.00 | Average Number Of Links With An Hub | 5.00 | Average Interaction Strength | 8.56 | Average Nodes In Shell | 25.00 | Average Hubs In Shell | 7.00 | Average Links In Shell | 31.00 | Average Links Mediated by Hubs In Shell | 29.00 |
| ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8IYS_N_N_1_res_stats.svg) Physico-chemical properties of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) | ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8IYS_N_N_1_pos_stats.svg) Location of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) |
|
Show | PDB | Class | SubFamily | Type | SubType | Species | Orthosteric Ligand | Other Ligand(s) | Protein Partners | Resolution | Date | DOI |
| 8JPB | A | Peptide | Neurotensin | NTS1 | Homo Sapiens | Neurotensin 8-13 | PubChem 118610427; GDP; Mg | Gq; GRK2 | 3.07 | 2023-08-09 | 10.1038/s41586-023-06395-9 |
![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8JPB_N_N_1.png)
A 2D representation of the interactions of GDP in 8JPB colored according to ConSurf Conservation Grade (See documentation):
(Click to enlarge 🔍) | Node1 | Node2 | LinkStrength | Comm | IsNode1Hub? | IsNode2Hub? | Node1Cons | Node2Cons | Node1Shell | Node2Shell | A:A:K52 | A:A:L44 | 4.23 | 0 | Yes | No | 9 | 8 | 1 | 2 | A:A:G46 | A:A:K52 | 3.49 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:?3 | A:A:G48 | 4.58 | 11 | Yes | No | 6 | 7 | 1 | 2 | A:A:K52 | A:A:S50 | 7.65 | 0 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:G51 | N:N:?1 | 7.4 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D205 | A:A:K52 | 4.15 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:G208 | A:A:K52 | 3.49 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:K52 | N:N:?1 | 10.67 | 0 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:S53 | A:A:T186 | 6.4 | 11 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:D205 | A:A:S53 | 5.89 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:S53 | N:N:?1 | 6.49 | 11 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:?2 | A:A:S53 | 5.77 | 11 | Yes | Yes | 5 | 9 | 1 | 1 | A:A:T54 | N:N:?1 | 14.34 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D155 | A:A:K275 | 6.91 | 11 | No | Yes | 8 | 9 | 1 | 1 | A:A:D155 | N:N:?1 | 15.41 | 11 | No | Yes | 8 | 0 | 1 | 0 | A:A:R181 | A:A:T332 | 3.88 | 39 | Yes | No | 6 | 9 | 2 | 1 | A:A:?2 | A:A:T186 | 8.49 | 11 | Yes | No | 5 | 9 | 1 | 2 | A:A:?3 | A:A:T186 | 3.94 | 11 | Yes | No | 6 | 9 | 1 | 2 | A:A:A231 | A:A:K275 | 4.82 | 0 | No | Yes | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:K275 | A:A:N274 | 5.6 | 11 | Yes | Yes | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:N274 | A:A:T329 | 4.39 | 11 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:A331 | A:A:N274 | 4.69 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:N274 | N:N:?1 | 9.65 | 11 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:K275 | N:N:?1 | 18.29 | 11 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D277 | A:A:L278 | 5.43 | 0 | Yes | No | 9 | 5 | 1 | 2 | A:A:D277 | A:A:E280 | 3.9 | 0 | Yes | Yes | 9 | 5 | 1 | 2 | A:A:C330 | A:A:D277 | 4.67 | 42 | No | Yes | 7 | 9 | 2 | 1 | A:A:D277 | N:N:?1 | 8.07 | 0 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:T332 | N:N:?1 | 16.73 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:?2 | N:N:?1 | 11.5 | 11 | Yes | Yes | 5 | 0 | 1 | 0 | A:A:?3 | N:N:?1 | 14.02 | 11 | Yes | Yes | 6 | 0 | 1 | 0 | A:A:?2 | A:A:?3 | 9.49 | 11 | Yes | Yes | 5 | 6 | 1 | 1 | |
Statistics | Value |
---|
Average Number Of Links | 11.00 | Average Number Of Links With An Hub | 7.00 | Average Interaction Strength | 12.05 | Average Nodes In Shell | 26.00 | Average Hubs In Shell | 10.00 | Average Links In Shell | 32.00 | Average Links Mediated by Hubs In Shell | 32.00 |
| ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8JPB_N_N_1_res_stats.svg) Physico-chemical properties of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) | ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8JPB_N_N_1_pos_stats.svg) Location of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) |
|
Show | PDB | Class | SubFamily | Type | SubType | Species | Orthosteric Ligand | Other Ligand(s) | Protein Partners | Resolution | Date | DOI |
| 8JPC | A | Peptide | Neurotensin | NTS1 | Homo Sapiens | Neurotensin 8-13 | PubChem 118610427; GDP; Mg | Gq; GRK2 | 3.07 | 2023-08-09 | 10.1038/s41586-023-06395-9 |
![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8JPC_N_N_1.png)
A 2D representation of the interactions of GDP in 8JPC colored according to ConSurf Conservation Grade (See documentation):
(Click to enlarge 🔍) | Node1 | Node2 | LinkStrength | Comm | IsNode1Hub? | IsNode2Hub? | Node1Cons | Node2Cons | Node1Shell | Node2Shell | A:A:K52 | A:A:L44 | 4.23 | 0 | Yes | No | 9 | 8 | 1 | 2 | A:A:G46 | A:A:K52 | 3.49 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:?403 | A:A:G48 | 4.58 | 9 | Yes | No | 0 | 7 | 1 | 2 | A:A:E49 | A:A:R183 | 6.98 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:K52 | A:A:S50 | 7.65 | 0 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:G51 | N:N:?1 | 7.4 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D205 | A:A:K52 | 4.15 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:G208 | A:A:K52 | 3.49 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:K52 | N:N:?1 | 10.67 | 0 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:S53 | A:A:T186 | 4.8 | 9 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:D205 | A:A:S53 | 5.89 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:S53 | N:N:?1 | 6.49 | 9 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:S53 | I:I:?1 | 5.77 | 9 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 1 | A:A:T54 | N:N:?1 | 14.34 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D155 | A:A:K275 | 6.91 | 9 | No | Yes | 8 | 9 | 1 | 1 | A:A:D155 | N:N:?1 | 15.41 | 9 | No | Yes | 8 | 0 | 1 | 0 | A:A:R181 | A:A:T332 | 3.88 | 34 | Yes | No | 6 | 9 | 2 | 1 | A:A:P185 | A:A:R183 | 7.21 | 0 | No | Yes | 7 | 9 | 2 | 1 | A:A:R183 | N:N:?1 | 8.54 | 9 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:?403 | A:A:R183 | 6.5 | 9 | Yes | Yes | 0 | 9 | 1 | 1 | A:A:T186 | I:I:?1 | 8.49 | 9 | No | Yes | 9 | 0 | 2 | 1 | A:A:?403 | A:A:T186 | 3.94 | 9 | Yes | No | 0 | 9 | 1 | 2 | A:A:A231 | A:A:K275 | 4.82 | 0 | No | Yes | 8 | 9 | 2 | 1 | A:A:K275 | A:A:N274 | 5.6 | 9 | Yes | Yes | 9 | 9 | 1 | 1 | A:A:N274 | A:A:T329 | 4.39 | 9 | Yes | No | 9 | 9 | 1 | 2 | A:A:A331 | A:A:N274 | 4.69 | 0 | No | Yes | 9 | 9 | 2 | 1 | A:A:N274 | N:N:?1 | 9.65 | 9 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:K275 | N:N:?1 | 18.29 | 9 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:D277 | A:A:L278 | 5.43 | 0 | Yes | No | 9 | 5 | 1 | 2 | A:A:D277 | A:A:E280 | 3.9 | 0 | Yes | Yes | 9 | 5 | 1 | 2 | A:A:C330 | A:A:D277 | 4.67 | 37 | No | Yes | 7 | 9 | 2 | 1 | A:A:D277 | N:N:?1 | 8.07 | 0 | Yes | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | A:A:T332 | N:N:?1 | 16.73 | 0 | No | Yes | 9 | 0 | 1 | 0 | I:I:?1 | N:N:?1 | 11.5 | 9 | Yes | Yes | 0 | 0 | 1 | 0 | A:A:?403 | N:N:?1 | 13.35 | 9 | Yes | Yes | 0 | 0 | 1 | 0 | A:A:?403 | I:I:?1 | 9.49 | 9 | Yes | Yes | 0 | 0 | 1 | 1 | A:A:R183 | A:A:S154 | 2.64 | 9 | Yes | No | 9 | 7 | 1 | 2 | |
Statistics | Value |
---|
Average Number Of Links | 12.00 | Average Number Of Links With An Hub | 8.00 | Average Interaction Strength | 11.70 | Average Nodes In Shell | 30.00 | Average Hubs In Shell | 11.00 | Average Links In Shell | 37.00 | Average Links Mediated by Hubs In Shell | 37.00 |
| ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8JPC_N_N_1_res_stats.svg) Physico-chemical properties of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) | ![](/psngpcr/ligands/GDP/GDP_8JPC_N_N_1_pos_stats.svg) Location of the nodes interacting with this ligand (click to enlarge 🔍) |
|